MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 171589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009445	GCATC	2	10	1157	1166	20 %	20 %	20 %	40 %	146337176
2	NC_009445	TGCGC	2	10	1189	1198	0 %	20 %	40 %	40 %	146337176
3	NC_009445	CGCC	2	8	1201	1208	0 %	0 %	25 %	75 %	146337176
4	NC_009445	CGC	2	6	1220	1225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
5	NC_009445	GC	3	6	1233	1238	0 %	0 %	50 %	50 %	146337176
6	NC_009445	GCC	2	6	1302	1307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
7	NC_009445	ATG	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337176
8	NC_009445	CGC	2	6	1330	1335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
9	NC_009445	CG	3	6	1400	1405	0 %	0 %	50 %	50 %	146337176
10	NC_009445	CTG	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
11	NC_009445	CGG	2	6	1523	1528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337176
12	NC_009445	CCG	2	6	1552	1557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
13	NC_009445	TCG	2	6	1576	1581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
14	NC_009445	AGG	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337176
15	NC_009445	CGA	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337176
16	NC_009445	GGT	2	6	1733	1738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337176
17	NC_009445	CGC	2	6	1742	1747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
18	NC_009445	GCC	2	6	1754	1759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
19	NC_009445	CGA	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337176
20	NC_009445	CGG	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337176
21	NC_009445	TCG	3	9	1813	1821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
22	NC_009445	CG	3	6	1867	1872	0 %	0 %	50 %	50 %	146337176
23	NC_009445	CGG	2	6	1876	1881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337176
24	NC_009445	CG	3	6	1884	1889	0 %	0 %	50 %	50 %	146337176
25	NC_009445	CAT	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337176
26	NC_009445	CTG	2	6	1986	1991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
27	NC_009445	CAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337176
28	NC_009445	CCGC	2	8	2060	2067	0 %	0 %	25 %	75 %	146337176
29	NC_009445	CGT	2	6	2105	2110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
30	NC_009445	CCT	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337176
31	NC_009445	CGC	2	6	2154	2159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
32	NC_009445	GCC	2	6	2239	2244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337176
33	NC_009445	CGG	2	6	2249	2254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337176
34	NC_009445	ACCAC	2	10	2260	2269	40 %	0 %	0 %	60 %	146337176
35	NC_009445	TGC	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337176
36	NC_009445	ACG	2	6	2326	2331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337176
37	NC_009445	CG	3	6	2677	2682	0 %	0 %	50 %	50 %	146337177
38	NC_009445	GCT	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337177
39	NC_009445	CGATCC	2	12	2735	2746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146337177
40	NC_009445	GC	3	6	2763	2768	0 %	0 %	50 %	50 %	146337177
41	NC_009445	GC	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	146337177
42	NC_009445	GCC	2	6	2830	2835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
43	NC_009445	ACCGCC	2	12	2839	2850	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	146337177
44	NC_009445	CCA	2	6	2855	2860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337177
45	NC_009445	GC	3	6	2940	2945	0 %	0 %	50 %	50 %	146337177
46	NC_009445	GCCG	2	8	2962	2969	0 %	0 %	50 %	50 %	146337177
47	NC_009445	CGC	2	6	3018	3023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
48	NC_009445	CGCA	2	8	3082	3089	25 %	0 %	25 %	50 %	146337177
49	NC_009445	GAG	2	6	3106	3111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337177
50	NC_009445	ATCT	2	8	3133	3140	25 %	50 %	0 %	25 %	146337177
51	NC_009445	CGG	2	6	3147	3152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337177
52	NC_009445	AGC	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337177
53	NC_009445	GC	3	6	3174	3179	0 %	0 %	50 %	50 %	146337177
54	NC_009445	AAC	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337177
55	NC_009445	TCG	3	9	3443	3451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337177
56	NC_009445	CGC	3	9	3465	3473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
57	NC_009445	CCA	2	6	3488	3493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337177
58	NC_009445	AGCG	2	8	3499	3506	25 %	0 %	50 %	25 %	146337177
59	NC_009445	CCG	2	6	3533	3538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
60	NC_009445	CGC	2	6	3657	3662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337177
61	NC_009445	CG	3	6	4049	4054	0 %	0 %	50 %	50 %	146337178
62	NC_009445	TGG	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337178
63	NC_009445	TTC	2	6	4139	4144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337178
64	NC_009445	GCG	2	6	4162	4167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337178
65	NC_009445	CGG	2	6	4221	4226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337178
66	NC_009445	GCC	2	6	4273	4278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
67	NC_009445	ACG	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337178
68	NC_009445	GCC	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
69	NC_009445	GCC	2	6	4419	4424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
70	NC_009445	CTT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337178
71	NC_009445	GCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
72	NC_009445	CGA	2	6	4534	4539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337178
73	NC_009445	CCG	2	6	4569	4574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
74	NC_009445	GTCGCC	2	12	4583	4594	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146337178
75	NC_009445	CGC	2	6	4624	4629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
76	NC_009445	TGC	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
77	NC_009445	GCC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337178
78	NC_009445	TGGA	2	8	4691	4698	25 %	25 %	50 %	0 %	146337178
79	NC_009445	GCT	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
80	NC_009445	CG	3	6	4745	4750	0 %	0 %	50 %	50 %	146337178
81	NC_009445	CTG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
82	NC_009445	GC	3	6	4769	4774	0 %	0 %	50 %	50 %	146337178
83	NC_009445	TGC	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
84	NC_009445	GAA	2	6	4840	4845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337178
85	NC_009445	GC	3	6	4853	4858	0 %	0 %	50 %	50 %	146337178
86	NC_009445	GCT	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
87	NC_009445	ACC	2	6	4931	4936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337178
88	NC_009445	TGC	3	9	4950	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
89	NC_009445	CGA	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337178
90	NC_009445	TCG	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337178
91	NC_009445	GTT	2	6	5002	5007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337178
92	NC_009445	GGC	2	6	5108	5113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337178
93	NC_009445	CCCG	2	8	5443	5450	0 %	0 %	25 %	75 %	146337179
94	NC_009445	GAAT	2	8	5484	5491	50 %	25 %	25 %	0 %	146337179
95	NC_009445	GTC	2	6	5605	5610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
96	NC_009445	CGA	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
97	NC_009445	CGA	2	6	5694	5699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
98	NC_009445	TCA	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
99	NC_009445	CGG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
100	NC_009445	CGG	2	6	5814	5819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
101	NC_009445	CGGCGT	2	12	5826	5837	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146337179
102	NC_009445	CGT	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
103	NC_009445	CGC	2	6	5933	5938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337179
104	NC_009445	GGT	2	6	5943	5948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337179
105	NC_009445	CCTCG	2	10	5988	5997	0 %	20 %	20 %	60 %	146337179
106	NC_009445	CAT	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
107	NC_009445	GAG	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337179
108	NC_009445	CGG	2	6	6141	6146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
109	NC_009445	GAG	2	6	6151	6156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337179
110	NC_009445	CAA	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337179
111	NC_009445	TGG	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337179
112	NC_009445	GTGCT	2	10	6280	6289	0 %	40 %	40 %	20 %	146337179
113	NC_009445	CAA	2	6	6294	6299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337179
114	NC_009445	CGG	2	6	6315	6320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337179
115	NC_009445	GAA	2	6	6387	6392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337179
116	NC_009445	CGA	2	6	6414	6419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
117	NC_009445	TCG	2	6	6475	6480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
118	NC_009445	CGT	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
119	NC_009445	TCA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
120	NC_009445	GAG	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337179
121	NC_009445	CGT	2	6	6588	6593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
122	NC_009445	GCC	2	6	6610	6615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337179
123	NC_009445	CG	3	6	6630	6635	0 %	0 %	50 %	50 %	146337179
124	NC_009445	GC	3	6	6640	6645	0 %	0 %	50 %	50 %	146337179
125	NC_009445	CAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337179
126	NC_009445	TCGCT	2	10	6677	6686	0 %	40 %	20 %	40 %	146337179
127	NC_009445	TCG	2	6	6743	6748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
128	NC_009445	CGGC	2	8	6758	6765	0 %	0 %	50 %	50 %	146337179
129	NC_009445	TGC	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
130	NC_009445	GCGT	2	8	6842	6849	0 %	25 %	50 %	25 %	146337179
131	NC_009445	CGAG	2	8	6866	6873	25 %	0 %	50 %	25 %	146337179
132	NC_009445	CGA	2	6	6915	6920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
133	NC_009445	ATC	2	6	6952	6957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
134	NC_009445	TGA	2	6	6959	6964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337179
135	NC_009445	CCGACG	2	12	6965	6976	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146337179
136	NC_009445	CTG	3	9	7000	7008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337179
137	NC_009445	TTC	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337179
138	NC_009445	ATC	2	6	7036	7041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337179
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141	NC_009445	CGA	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337179
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159	NC_009445	GCCGC	2	10	7818	7827	0 %	0 %	40 %	60 %	146337179
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231	NC_009445	GCTG	2	8	11107	11114	0 %	25 %	50 %	25 %	146337183
232	NC_009445	CTT	2	6	11117	11122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337183
233	NC_009445	GCGAT	2	10	11188	11197	20 %	20 %	40 %	20 %	146337183
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244	NC_009445	CG	4	8	11554	11561	0 %	0 %	50 %	50 %	146337183
245	NC_009445	CT	3	6	11574	11579	0 %	50 %	0 %	50 %	146337183
246	NC_009445	GCC	2	6	11642	11647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337183
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248	NC_009445	CCG	2	6	11745	11750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337183
249	NC_009445	CTG	2	6	11818	11823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337183
250	NC_009445	GTC	2	6	11834	11839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337183
251	NC_009445	CGC	2	6	11845	11850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337183
252	NC_009445	CCT	2	6	12880	12885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337184
253	NC_009445	CGC	2	6	12904	12909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337184
254	NC_009445	ACC	2	6	12914	12919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337184
255	NC_009445	CT	3	6	12920	12925	0 %	50 %	0 %	50 %	146337184
256	NC_009445	CGC	2	6	12956	12961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337184
257	NC_009445	GAT	2	6	12995	13000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337184
258	NC_009445	GCG	2	6	13033	13038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337184
259	NC_009445	GCC	2	6	13053	13058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337184
260	NC_009445	TCG	2	6	13078	13083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337184
261	NC_009445	CGG	2	6	13111	13116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337184
262	NC_009445	CGC	2	6	13120	13125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337184
263	NC_009445	TGA	2	6	13148	13153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337184
264	NC_009445	GCG	2	6	13166	13171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337184
265	NC_009445	CG	3	6	13170	13175	0 %	0 %	50 %	50 %	146337184
266	NC_009445	TCG	2	6	13204	13209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337184
267	NC_009445	GCT	2	6	13427	13432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337184
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270	NC_009445	TGC	2	6	13612	13617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337184
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274	NC_009445	CGC	2	6	13724	13729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337184
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282	NC_009445	GCT	3	9	13994	14002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337184
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286	NC_009445	GCT	3	9	14087	14095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337184
287	NC_009445	GCT	2	6	14216	14221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337184
288	NC_009445	TGC	2	6	14224	14229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337184
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290	NC_009445	GATC	2	8	14347	14354	25 %	25 %	25 %	25 %	146337185
291	NC_009445	CGAG	2	8	14374	14381	25 %	0 %	50 %	25 %	146337185
292	NC_009445	GAA	2	6	14393	14398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337185
293	NC_009445	CG	3	6	14425	14430	0 %	0 %	50 %	50 %	146337185
294	NC_009445	CGG	2	6	14449	14454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337185
295	NC_009445	CGG	2	6	14504	14509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337185
296	NC_009445	CAC	2	6	14621	14626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337185
297	NC_009445	ATC	2	6	14640	14645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337185
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299	NC_009445	GCA	2	6	14677	14682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337185
300	NC_009445	CGA	2	6	14702	14707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337185
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331	NC_009445	GCG	2	6	16004	16009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337186
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381	NC_009445	CGC	2	6	17827	17832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337187
382	NC_009445	GCA	2	6	17913	17918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337187
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384	NC_009445	CCGAGC	2	12	18020	18031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146337187
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386	NC_009445	GCAG	2	8	18220	18227	25 %	0 %	50 %	25 %	146337187
387	NC_009445	GTG	3	9	18251	18259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337187
388	NC_009445	ACG	2	6	18266	18271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337187
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390	NC_009445	GGC	2	6	18282	18287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337187
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394	NC_009445	CGC	2	6	18487	18492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337188
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420	NC_009445	GGC	3	9	19471	19479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337188
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462	NC_009445	TGA	2	6	21292	21297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337190
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471	NC_009445	TGA	2	6	22378	22383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337191
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493	NC_009445	CGT	2	6	23331	23336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
494	NC_009445	CGG	2	6	23340	23345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337192
495	NC_009445	GCCTC	2	10	23360	23369	0 %	20 %	20 %	60 %	146337192
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497	NC_009445	CCA	2	6	23486	23491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337192
498	NC_009445	CGG	3	9	23568	23576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337192
499	NC_009445	TGC	2	6	23582	23587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337192
500	NC_009445	AGC	2	6	23606	23611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337192

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